শেক-ফ্লাস্ক কালচারিং সারফেস কালচারিং থেকে আলাদা যেখানে কোষগুলি সরাসরি উচ্চ অক্সিজেন ঘনত্বের সংস্পর্শে আসে। শেক-ফ্লাস্ক সংস্কৃতিতে, কোষগুলি কম অক্সিজেনের ঘনত্বের সংস্পর্শে আসে যেহেতু অণুজীবগুলি কালচার ব্রোথে স্থগিত থাকে।